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As proteínas são as macromoléculas presentes em todos os seres vivos e amplamente utilizadas em diversas áreas da indústria. Dias (2012) desenvolveu a ferramenta RID (Residue Interaction Database), capaz de propor mutações sítio-dirigidas em proteínas, com base em sua estrutura tridimensional. Este trabalho tem como objetivo aperfeiçoar os módulos gerais e métodos computacionais de proposição de mutação utilizados da ferramenta RID. A arquitetura Web da ferramenta RID foi reformulada utilizando o framework Django, com a construção de uma nova interface, visando a melhoria da usabilidade e experiência do usuário. Os scripts necessários para o processamento das estruturas proteicas utilizadas como base de dados foram alterados para se obter melhor legibilidade e adaptabilidade de código à arquitetura nova, utilizando para isso ShellScript e o banco de dados Postgres. Estudou-se também uma nova etapa no agrupamento de estruturas de pares de aminoácidos interagentes utilizando o algoritmo K-means ||, para que se identifique grupos de pares de aminoácidos com estruturas semelhantes. Para suportar o algoritmo K-means || foi construída uma arquitetura envolvendo o framework Apache Hadoop junto com a biblioteca Spark. A base de dados inicial utilizada no trabalho foi de 16383 arquivos de pares de aminoácidos com interações de ponte dissulfeto, sendo essa base de dados crescida ao longo do projeto para que se explore a escalabilidade da solução.

Proteína. Mutação. Bioinformática estrutural.