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O tempo gasto por profissionais da bioquímica para a análise da estabilidade e viabilidade de uma mutação proteica é demasiadamente grande, e portanto pesquisas no âmbito da bioquímica aplicada à proteínas que use da computação de alta performance para a aquisição destas informações pode ser considerado necessário. O presente projeto de pesquisa tem como objetivo criar uma base de triagem de arquivos PDB (Protein Data Bank) para armazenar o levantamento e a caracterização de interações intramoleculares proteicas presentes no banco de dados, além de viabilizar as análises estatísticas envolvendo estas interações. Motivados pelo projeto desenvolvido por Dias (2012), as interações entre pares de aminoácidos pertencentes às cadeias polipeptídicas das proteínas do PDB foram identificadas, isoladas e armazenadas em um banco de interações, que alimentará um projeto maior do grupo de pesquisa que é o sistema RID (Residue Information Database). Neste sistema o profissional da bioquímica poderá submeter um arquivo de estrutura de proteína e avaliar uma proposição de mutação. O uso do cluster de computadores do CEFET-MG foi crucial para a obtenção do enorme volume de arquivos de interações (milhões) extraídos do banco de dados PDB.

Proteína. Interação. Bioinformática estrutural.