Portal de Administração de Conferências - CEFET-MG, 27ª Mostra Específica de Trabalhos e Aplicações

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Implantação, evolução e aprimoramento do projeto RID (Residue Interaction Database) para proposição de mutação sítio dirigida em proteínas
Sandro Renato Dias, Higor Coimbra Amorim

Última alteração: 2017-08-29

Resumo


A bioinformática é um ramo da ciência de caráter interdisciplinar, que tem como objetivo conectar dados e interpretação científica por meio de ferramentas computacionais. Dentro das aplicações da bioinformática no estudo das estruturas de proteínas foi desenvolvido o sistema RID, tal sistema é descrito na literatura como uma base de dados de pares de aminoácidos interagentes com possibilidade de inserção de mutações de forma a obter novas interações nos pares mutados. A estabilidade obtida como resultado das mutações possibilitaria a uma proteína atuar em ambientes denominados "agressivos", onde se percebe grandes variações de parâmetros como temperatura e pH, por exemplo. Nesse contexto, este trabalho possui 2 objetivos principais: O primeiro, de refatoração, utilizando o framework web Django, do sistema RID, que inicialmente foi desenvolvido em linguagem PHP. O framework Django se baseia na linguagem Python que apresenta vantagens em relação ao PHP sendo as principais: maior segurança e melhor performance como explicados na literatura. O segundo objetivo é a integração do sistema RID, já refatorado, com o cluster de alto desempenho, localizado no DECOM CEFET-MG, que proporcionará a melhoria de performance de aspectos relacionados aos experimentos realizados pelos usuários dentro do sistema

Palavras-chave


Bioinformática estrutural. Proteína. Mutação sítio dirigida.