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PLATAFORMA PARA INTEGRAÇÃO E AUTOMATIZAÇÃO DE APLICAÇÕES EM SIMULAÇÕES DE TRIAGEM VIRTUAL
Última alteração: 2021-09-22
Resumo
https://youtu.be/PgVE6MIqUcU
O desenvolvimento de fármacos por técnicas in silico, as quais empregam técnicas de modelagem molecular, tem ganhado destaque, pois possibilita ao pesquisador simular e predizer vários fatores essenciais, como toxidade, atividade, biodisponibilidade e eficácia, antes mesmo do composto ser submetido a testes in vitro, permitindo um melhor planejamento e direcionamento nos experimentos, o que pode reduzir o tempo e os custos envolvidos na pesquisa de novos fármacos. A Triagem Virtual (TV) é uma ferramenta de modelagem molecular que busca direcionar a seleção de moléculas orgânicas para alvos terapêuticos de interesse. O processo de TV é realizado com o auxílio de diversos softwares, dentre eles o Pymol, MGLTools, MOPAC e AutoDock Vina, e cada um deles é responsável por uma etapa específica do processo. O principal problema encontrado no uso desses aplicativos é que eles não trabalham de forma integrada. Além disso, esses softwares não possuem uma interface amigável. Neste contexto, este projeto continua o desenvolvimento e o aperfeiçoamento de softwares com interface simples e intuitiva que automatizem o processo de TV integrando os aplicativos que realizam as diversas etapas do processo. Diferente de outras plataformas de TV, as aplicações desenvolvidas/aperfeiçoadas realizam as simulações de um número ilimitado de compostos em um conjunto de alvos moleculares. Nessa etapa do trabalho, o sotware foi atualizado para funcionar com a versão 20.04 do Ubuntu, pois ele só funcionava na versão 18.04. Além disso, a integração do software com o Windows foi aperfeiçoada. Com isso, ele funciona no windows tão bem quanto no Linux, realizando simulações no Linux de forma tão rápida quanto no Windows.
O desenvolvimento de fármacos por técnicas in silico, as quais empregam técnicas de modelagem molecular, tem ganhado destaque, pois possibilita ao pesquisador simular e predizer vários fatores essenciais, como toxidade, atividade, biodisponibilidade e eficácia, antes mesmo do composto ser submetido a testes in vitro, permitindo um melhor planejamento e direcionamento nos experimentos, o que pode reduzir o tempo e os custos envolvidos na pesquisa de novos fármacos. A Triagem Virtual (TV) é uma ferramenta de modelagem molecular que busca direcionar a seleção de moléculas orgânicas para alvos terapêuticos de interesse. O processo de TV é realizado com o auxílio de diversos softwares, dentre eles o Pymol, MGLTools, MOPAC e AutoDock Vina, e cada um deles é responsável por uma etapa específica do processo. O principal problema encontrado no uso desses aplicativos é que eles não trabalham de forma integrada. Além disso, esses softwares não possuem uma interface amigável. Neste contexto, este projeto continua o desenvolvimento e o aperfeiçoamento de softwares com interface simples e intuitiva que automatizem o processo de TV integrando os aplicativos que realizam as diversas etapas do processo. Diferente de outras plataformas de TV, as aplicações desenvolvidas/aperfeiçoadas realizam as simulações de um número ilimitado de compostos em um conjunto de alvos moleculares. Nessa etapa do trabalho, o sotware foi atualizado para funcionar com a versão 20.04 do Ubuntu, pois ele só funcionava na versão 18.04. Além disso, a integração do software com o Windows foi aperfeiçoada. Com isso, ele funciona no windows tão bem quanto no Linux, realizando simulações no Linux de forma tão rápida quanto no Windows.
Palavras-chave
Software. Triagem virtual. Bioinformática.